Сезон розгортається через три місяці після трагічних подій на горі Везер. Головна героїня, лідерка "Скайкру", намагається впоратися з тягарем провини за масові жертви, віддалившись від своїх людей у лісах. Тим часом її народ у таборі Аркадія укладає крихкий союз із "Граундерами", але мир опиняється під загрозою через внутрішні конфлікти та появу нової сили — штучного інтелекту А.Л.І.Е., який обіцяє безсмертя в цифровому "Місті Світла", але забирає свободу волі. Герої розходяться у поглядах: одні прагнуть знищити А.Л.І.Е., інші бачать у ній спасіння. Сезон досліджує теми моралі, влади та виживання, коли "Скайкру" і "Граундери" змушені об’єднатися проти спільного ворога.